To understand the function of an RNA molecule, similar to the better-known DNA and vital for cell metabolism, we need to know its three-dimensional structure. Unfortunately, establishing the shape of an RNA strand is anything but easy and often requires a combination of experimental techniques and computer-based simulations. Many computing methods are used but these are often complex and slow, and vary depending on the problem at hand. A team of scientists from SISSA – the International School for Advanced Studies of Trieste – has devised a simple and versatile method, based on the geometry of the RNA molecule, which proved to be highly promising for analysing and understanding the complex interactions that characterise these molecules.
Per capire la funzione di una molecola di RNA, simile al più noto DNA e fondamentale nel metabolismo cellulare, è importante conoscerne la struttura tridimensionale. Purtroppo stabilire che forma abbia un filamento di RNA è tutt’altro che semplice e spesso è necessario combinare le tecniche sperimentali con simulazioni al computer. Molti sono i metodi computazionali utilizzati, spesso complessi, lenti e diversi a seconda del problema specifico. Un team di scienziati della SISSA - la Scuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati di Trieste - ha ideato una tecnica semplice e “trasversale”, basata sulla geometria della molecola di RNA, che si è dimostrata molto promettente per analizzare e comprendere le complesse interazioni che caratterizzano queste molecole